Studii De Asociere
Public syllabus for 2025-2026
Academic overview
Teaching team
Learning time distribution
| Total | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Curriculum | Lecture | Practice | Total Weekly | Lecture | Practice | |
| 42 | 28 | 14 | 3 | 2 | 1 | |
| Exam hours | ||||||
| 8 | ||||||
| Individual Study | Bibliography study | Field study | Homework | Tutoring | Others | |
| 100 | 35 | 30 | 30 | 5 | 0 | |
| Overall | ||||||
| 150 |
Learning outcomes
Knowledge
- (6a03a0962355ae3a04d2f331) Cunoașterea unor concepte fundamentale din programare, algoritmică, statistică, chimie, biologie moleculară, genetică, precum și a unor concepte specifice domeniului bioinformaticii;
- (C2) Familiarizarea cu concepte și metode utilizate în cadrul studiilor de asociere între genotip și genotip
Skills
- (A1) Identificarea metodelor și instrumentelor bioinformatice adecvate studiului diferitelor tipuri de date fenotipice
- (A2) Utilizarea conceptelor din informatică, statistică și genetică pentru identificarea relațiilor dintre genotip și fenotip
Responsibility
- (6a03a0962355ae3a04d2f33e) Responsabilitate de acțiune în conformitate cu interesul public; angajament relativ la sănătatea, siguranța și bunăstarea populației;
- (6a03a0962355ae3a04d2f33f) Respectarea confidențialității angajatorului și a clienților și protejarea proprietății intelectuale a acestora;
- (6a03a0962355ae3a04d2f340) Reprezentarea corectă a nivelului de competență și acceptarea de sarcini în limitele acestuia;
- (6a03a0962355ae3a04d2f341) Responsabilitatea de a respecta cele mai înalte standarde profesionale în prelucrarea datelor biomedicale;
- (6a03a0962355ae3a04d2f342) Păstrarea autonomiei, integrității și independenței în opiniile profesionale;
- (6a03a0962355ae3a04d2f343) Promovarea integrității și reputației profesiei, în concordanță cu interesul public;
- (6a03a0962355ae3a04d2f344) Perfecționarea continuă relativ la practicarea profesiei;
- (6a03a0962355ae3a04d2f345) Comportament etic, cinstit și colegial în practicarea profesiei.
Online platform
Course content
| Content | Methods | Obs |
|---|---|---|
| Recapitulare noțiuni de bază de biologie și genetică moleculară | Prelegere, exemplificare. | 2 ore Cursurile se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom. |
| Variații genomice. Formate de reprezentare pentru acest tip de date. Tehnologia de secvențiere „sequencing by synthesis” | Prelegere, exemplificare. | 4 ore Cursurile se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom |
| Noțiuni de bază în algebra liniară. Analiza componentelor principale | Prelegere, exemplificare. | 4 ore Cursurile se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom |
| Înlănțuirea genetică (linkage disequilibrium). Noțiuni privind genetica populațiilor | Prelegere, exemplificare. | 4 ore Cursurile se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom |
| Testarea ipotezelor statistice. | Prelegere, exemplificare. | 4 ore Cursurile se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom |
| Fenotipuri complexe și interacțiunea dintre genetică și mediu | Prelegere, exemplificare. | 6 ore Cursurile se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom |
| Studii de asociere genomică. Studii de tip eQTL | Prelegere, exemplificare. | 4 ore Cursurile se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom |
Course bibliography
1. Zheng, G., Yang, Y., Zhu, X. and Elston, R.C., 2012. Analysis of genetic association studies. Springer Science & Business Media. 2. Gondro, C., Van der Werf, J. and Hayes, B. eds., 2013. Genome-wide association studies and genomic prediction (p. 566). Totowa, NJ, USA. Humana Press. 3. Weller, J., 2016. Genomic selection in animals. John Wiley & Sons. 4. Oldenbroek, K. and van der Waaij, L., 2015. Textbook animal breeding and genetics for BSc students. Centre for Genetic Resources, The Netherlands and Animal Breeding and Genomics Centre.
Seminar content
| Content | Methods | Obs |
|---|---|---|
| Comenzi de bază în Linux. Utilizarea prin linie de comandă | Problematizare, dialog, colaborare | 2 ore Laboratoarele se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom. |
| Unelte software în linie de comandă pentru lucrul cu fișiere în format VCF | Problematizare, dialog, colaborare | 2 ore Laboratoarele se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom. |
| Calculul frecvenței alelelor pentru variațiile genetice. Pachete R pentru lucrul cu fișiere în format VCF | Problematizare, dialog, colaborare | 2 ore Laboratoarele se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom. |
| PCA: analiza componentelor principale pe date genotipice | Problematizare, dialog, colaborare | 2 ore Laboratoarele se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom. |
| Prelucrarea datelor genealogice folosind pachete R | Problematizare, dialog, colaborare | 2 ore Laboratoarele se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom. |
| Studii de asociere pe un număr redus de markeri genetici | Problematizare, dialog, colaborare | 2 ore Laboratoarele se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom. |
| GWAS: studii de asociere la nivelul genomului | Problematizare, dialog, colaborare | 2 ore Laboratoarele se vor desfășura online utilizând platformele Google Meet și Google Classroom. |
Seminar bibliography
1. Zheng, G., Yang, Y., Zhu, X. and Elston, R.C., 2012. Analysis of genetic association studies. Springer Science & Business Media. 2. Gondro, C., Van der Werf, J. and Hayes, B. eds., 2013. Genome-wide association studies and genomic prediction (p. 566). Totowa, NJ, USA. Humana Press. 3. Weller, J., 2016. Genomic selection in animals. John Wiley & Sons. 4. Oldenbroek, K. and van der Waaij, L., 2015. Textbook animal breeding and genetics for BSc students. Centre for Genetic Resources, The Netherlands and Animal Breeding and Genomics Centre.
Corroboration
Conținutul este în concordanță cu structura cursurilor similare de la alte universități și acoperă aspectele fundamentale necesare familiarizării cu problematica bioinformaticii.
AI tools guidance
Evaluation and delivery
| Activity | Criteria | Methods | Percentage |
|---|---|---|---|
| C |
|
|
|
| S |
|
|
|
Performance standards
● Realizarea unei ponderi de 50% din examenul aferent părții teoretice (curs) ● Realizarea unei ponderi de 50% la evaluarea părții aplicative (laborator)
Additional info
(none)